我们都知道，微生物法没有得到广泛的使用，其中一个主要原因是受其抗冲击、抗干扰能力的影响。微生物系统在运作过程中，有毒害物质、重金属物质及过高的污染物含量、突增水量或是温度的变化都可以给其带来及大的冲击，造成生化系统处理能力下降，微生物中毒、生化系统崩溃。
余氯包括氯气、次氯酸、次氯酸盐离子及游离次氯酸单体，这些物质可以改变微生物细胞膜的通透性，进入微生物细胞中干扰、破坏微生物的酶系统，凝固病原微生物的蛋白质及使其变性。即起到抑制其生长或杀死微生物的作用。
疫情期间，各地大量使用含氯消毒剂，很容易使残余氯随着进入污水处理池中，污水厂的进水余氯浓度突然升高，使好氧池中泡沫突增，DO值下降，活性污泥絮凝性变差，悬浮颗粒大量涌现，沉降缓慢，生化系统处理能力大大降低，甚至导致大量微生物死亡，生化系统崩溃。
而大部分城镇污水处理厂都有生化处理系统，因此，需要在进水时尽可能控制余氯含量。增加预处理，增加活性污泥活性及提高污泥浓度，通过增加溶解氧、加强剩余污泥排放、添加激活菌、复合碳源等提高生化系统抗冲击能力及恢复能力。
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