在许多废水处理方法中，微生物处理方法因其操作简单，效果显着，自然环保，二次破坏少等优点而成为最重要的废水处理方法。诸如生物膜法和活性污泥法的方法。
现代工业废水中的污染源类型非常混乱。为了达到降解废水中污染物的目的，选择具有特殊降解能力的微生物进行培养，以获得稳定，耐冲击，耐盐的废水。通过一系列驯化，污水处理菌种可以有效去除氨氮，BOD，COD，SS，硝酸盐，硫酸盐，颜色，气味，有毒物质，化学污染物等。废水经过正面预处理，然后经过厌氧和好氧生化阶段，可以有效降解水中的各种污染物。
工业废水
污水处理菌种按其功能主要分为以下几类：
1.污水处理菌种之硝化细菌：是一种需氧细菌，包括亚硝化细菌和硝化细菌。在氮循环的水净化过程中起着非常重要的作用。
2.污水处理菌种之反硝化细菌：反硝化细菌是一种会进行反硝化作用的细菌。它们大多数是异养和兼性厌氧细菌，例如反硝化杆菌，斯氏杆菌、萤气极毛杆菌。在氙气条件下，他们利用硝酸中的氧来氧化有机物质，以此来获得其自身重要活动所需的能量。反硝化细菌广泛分布在土壤，肥料和污水中。它可以将硝酸盐氮转化为氮而不是氨。它主要用于废水处理，例如景观水处理，城市河流处理，水产养殖处理等。
污水处理菌种之反硝化细菌
3.污水处理细菌的硝化和反硝化复合细菌：具有硝化和反硝化双重作用的复合细菌。在日益混乱的废水处理环境中，仅使用硝化或反硝化细菌来接触细菌越来越困难。公司也难以准确地了解硝化和反硝化的比率，这导致大量的有害细菌或缺乏细菌，并且难以获得所需的废水处理效果。复合细菌可以根据水质膨胀和繁殖，并达到细菌的平衡，使废水处理更简单，更有效。